Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF3P78545 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF3P78545 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF3P78545 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF3P78545 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF3P78545 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF3P78545 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF3P78545 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF3P78545 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF3P78545 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF3P78545 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF3P78545 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF3P78545 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF3P78545 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF3P78545 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF3P78545 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF3P78545 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF3P78545 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF3P78545 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF3P78545 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF3P78545 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF3P78545 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF3P78545 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF3P78545 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF3P78545 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF3P78545 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF3P78545 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF3P78545 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF3P78545 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF3P78545 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ELF3P78545 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF3P78545 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ELF3P78545 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms