Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL2P60520 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL2P60520 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL2P60520 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL2P60520 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL2P60520 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL2P60520 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABARAPL2P60520 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABARAPL2P60520 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GABARAPL2P60520 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms