Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NrlP54846 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NrlP54846 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NrlP54846 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NrlP54846 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NrlP54846 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NrlP54846 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NrlP54846 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NrlP54846 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NrlP54846 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NrlP54846 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NrlP54846 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NrlP54846 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NrlP54846 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NrlP54846 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NrlP54846 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NrlP54846 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NrlP54846 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NrlP54846 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NrlP54846 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NrlP54846 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NrlP54846 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NrlP54846 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NrlP54846 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NrlP54846 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NrlP54846 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NrlP54846 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NrlP54846 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NrlP54846 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NrlP54846 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NrlP54846 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NrlP54846 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NrlP54846 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NrlP54846 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NrlP54846 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NrlP54846 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NrlP54846 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NrlP54846 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NrlP54846 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NrlP54846 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NrlP54846 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NrlP54846 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NrlP54846 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NrlP54846 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NrlP54846 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NrlP54846 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NrlP54846 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NrlP54846 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NrlP54846 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NrlP54846 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NrlP54846 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NrlP54846 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms