Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRYBA4P53673 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms