Protein–RNA interactions for Protein: P51826

AFF3, AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3P51826 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFF3P51826 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AFF3P51826 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFF3P51826 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF3P51826 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF3P51826 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF3P51826 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF3P51826 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF3P51826 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF3P51826 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF3P51826 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF3P51826 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFF3P51826 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF3P51826 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF3P51826 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF3P51826 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF3P51826 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF3P51826 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF3P51826 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF3P51826 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFF3P51826 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF3P51826 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF3P51826 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF3P51826 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF3P51826 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF3P51826 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF3P51826 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF3P51826 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF3P51826 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF3P51826 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF3P51826 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms