Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl6P47911 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl6P47911 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl6P47911 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms