Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nedd4P46935 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nedd4P46935 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nedd4P46935 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms