Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf1P46099 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf1P46099 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf1P46099 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf1P46099 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf1P46099 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf1P46099 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms