Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCG1P45844 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms