Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A3P38919 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms