Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk2P38575 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upk2P38575 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Upk2P38575 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms