Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ly6dP35459 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ly6dP35459 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms