Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rom1P32958 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rom1P32958 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rom1P32958 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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