Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casp1P29452 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp1P29452 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp1P29452 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp1P29452 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms