Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtmaP26350 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtmaP26350 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtmaP26350 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtmaP26350 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms