Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf1aP25118 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf1aP25118 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153 ms