Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm3P21107 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpm3P21107 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpm3P21107 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms