Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA1P20827 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA1P20827 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA1P20827 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA1P20827 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA1P20827 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA1P20827 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA1P20827 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA1P20827 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFNA1P20827 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA1P20827 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA1P20827 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA1P20827 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms