Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcna3P16390 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcna3P16390 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcna3P16390 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcna3P16390 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcna3P16390 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcna3P16390 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcna3P16390 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcna3P16390 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms