Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhoP15409 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhoP15409 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhoP15409 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhoP15409 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhoP15409 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RhoP15409 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhoP15409 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhoP15409 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhoP15409 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhoP15409 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhoP15409 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhoP15409 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhoP15409 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhoP15409 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhoP15409 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhoP15409 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhoP15409 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RhoP15409 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RhoP15409 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RhoP15409 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RhoP15409 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhoP15409 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhoP15409 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RhoP15409 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhoP15409 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhoP15409 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhoP15409 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhoP15409 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RhoP15409 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoP15409 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoP15409 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoP15409 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoP15409 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoP15409 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoP15409 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RhoP15409 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoP15409 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoP15409 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoP15409 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoP15409 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RhoP15409 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RhoP15409 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RhoP15409 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoP15409 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoP15409 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoP15409 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoP15409 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoP15409 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoP15409 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoP15409 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoP15409 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RhoP15409 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoP15409 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoP15409 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoP15409 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoP15409 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoP15409 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RhoP15409 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RhoP15409 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RhoP15409 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RhoP15409 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms