Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYL1P12980 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYL1P12980 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYL1P12980 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYL1P12980 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYL1P12980 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYL1P12980 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYL1P12980 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYL1P12980 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYL1P12980 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYL1P12980 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYL1P12980 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LYL1P12980 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYL1P12980 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYL1P12980 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYL1P12980 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYL1P12980 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYL1P12980 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYL1P12980 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms