Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BMP3P12645 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BMP3P12645 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BMP3P12645 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BMP3P12645 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BMP3P12645 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BMP3P12645 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BMP3P12645 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BMP3P12645 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BMP3P12645 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BMP3P12645 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BMP3P12645 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BMP3P12645 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BMP3P12645 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BMP3P12645 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BMP3P12645 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BMP3P12645 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BMP3P12645 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BMP3P12645 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BMP3P12645 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BMP3P12645 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BMP3P12645 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BMP3P12645 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BMP3P12645 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BMP3P12645 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BMP3P12645 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BMP3P12645 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BMP3P12645 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BMP3P12645 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BMP3P12645 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BMP3P12645 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BMP3P12645 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BMP3P12645 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BMP3P12645 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BMP3P12645 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BMP3P12645 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BMP3P12645 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BMP3P12645 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BMP3P12645 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BMP3P12645 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BMP3P12645 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BMP3P12645 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BMP3P12645 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BMP3P12645 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BMP3P12645 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms