Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PABPC1P11940 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PABPC1P11940 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms