Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF888P0CJ79 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF888P0CJ79 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms