Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr2aP08775 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr2aP08775 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2aP08775 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms