Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBXN7O94888 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN7O94888 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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