Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vamp4O70480 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vamp4O70480 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms