Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNSO60931 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNSO60931 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNSO60931 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNSO60931 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNSO60931 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTNSO60931 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNSO60931 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNSO60931 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNSO60931 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNSO60931 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNSO60931 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNSO60931 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNSO60931 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNSO60931 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNSO60931 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNSO60931 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNSO60931 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNSO60931 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNSO60931 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNSO60931 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms