Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf5O35445 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms