Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPEF1O14829 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPEF1O14829 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms