Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21900J3QP38 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21900J3QP38 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms