Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200cJ3QK46 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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