Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rfx7F8VPJ6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rfx7F8VPJ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Rfx7F8VPJ6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Rfx7F8VPJ6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rfx7F8VPJ6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Rfx7F8VPJ6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Rfx7F8VPJ6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rfx7F8VPJ6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms