Protein–RNA interactions for Protein: F7CNM6

1700056E22Rik, RIKEN cDNA 1700056E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700056E22RikF7CNM6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
1700056E22RikF7CNM6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700056E22RikF7CNM6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms