Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2610001J05RikF2Z3Y9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms