Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cdh18E9Q9Q6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cdh18E9Q9Q6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdh18E9Q9Q6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms