Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Srsf11E9Q6E5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf11E9Q6E5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf11E9Q6E5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms