Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm17728E9Q5K2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm17728E9Q5K2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.5 ms