Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc144bE9PVZ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc144bE9PVZ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms