Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calhm1D3Z291 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Calhm1D3Z291 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms