Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprbB2RU80 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms