Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Brpf1B2RRD7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brpf1B2RRD7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brpf1B2RRD7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms