Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp42B2RQC2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp42B2RQC2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp42B2RQC2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms