Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RIMBP3BA6NNM3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RIMBP3BA6NNM3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms