Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6L9A6NEM1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA6L9A6NEM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA6L9A6NEM1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms