Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm6880A3KG45 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm6880A3KG45 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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