Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933424G06RikA0A140LIP3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms