Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv30A0A0B4J1P1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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