Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubl3Q9Z2M6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubl3Q9Z2M6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubl3Q9Z2M6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubl3Q9Z2M6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubl3Q9Z2M6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubl3Q9Z2M6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubl3Q9Z2M6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubl3Q9Z2M6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubl3Q9Z2M6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubl3Q9Z2M6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl3Q9Z2M6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl3Q9Z2M6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubl3Q9Z2M6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubl3Q9Z2M6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubl3Q9Z2M6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubl3Q9Z2M6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubl3Q9Z2M6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubl3Q9Z2M6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubl3Q9Z2M6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubl3Q9Z2M6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubl3Q9Z2M6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubl3Q9Z2M6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubl3Q9Z2M6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubl3Q9Z2M6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubl3Q9Z2M6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubl3Q9Z2M6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubl3Q9Z2M6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubl3Q9Z2M6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubl3Q9Z2M6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl3Q9Z2M6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubl3Q9Z2M6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubl3Q9Z2M6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubl3Q9Z2M6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubl3Q9Z2M6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubl3Q9Z2M6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubl3Q9Z2M6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubl3Q9Z2M6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms