Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN6Q9Y6Q1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAPN6Q9Y6Q1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPN6Q9Y6Q1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPN6Q9Y6Q1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAPN6Q9Y6Q1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAPN6Q9Y6Q1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAPN6Q9Y6Q1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAPN6Q9Y6Q1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAPN6Q9Y6Q1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAPN6Q9Y6Q1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN6Q9Y6Q1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN6Q9Y6Q1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAPN6Q9Y6Q1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAPN6Q9Y6Q1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN6Q9Y6Q1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAPN6Q9Y6Q1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CAPN6Q9Y6Q1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPN6Q9Y6Q1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPN6Q9Y6Q1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPN6Q9Y6Q1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN6Q9Y6Q1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAPN6Q9Y6Q1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAPN6Q9Y6Q1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAPN6Q9Y6Q1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPN6Q9Y6Q1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN6Q9Y6Q1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN6Q9Y6Q1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPN6Q9Y6Q1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPN6Q9Y6Q1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAPN6Q9Y6Q1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAPN6Q9Y6Q1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAPN6Q9Y6Q1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN6Q9Y6Q1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN6Q9Y6Q1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPN6Q9Y6Q1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPN6Q9Y6Q1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPN6Q9Y6Q1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN6Q9Y6Q1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPN6Q9Y6Q1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN6Q9Y6Q1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN6Q9Y6Q1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN6Q9Y6Q1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN6Q9Y6Q1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN6Q9Y6Q1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN6Q9Y6Q1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN6Q9Y6Q1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN6Q9Y6Q1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPN6Q9Y6Q1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPN6Q9Y6Q1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CAPN6Q9Y6Q1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPN6Q9Y6Q1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN6Q9Y6Q1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms